山东省部分地区脑炎与非脑炎手足口病肠道病毒71型VP1区基因特征

作者：张乐海; 马丽霞; 王世富; 刘霞; 姜忠强; 于华凤

来源：中国病原生物学杂志, 2010, 5(08): 567-571.

DOI：10.13350/j.cjpb.2010.08.010

• 肠道病毒71型
• 手足口病
• 脑炎
• 核苷酸序列

目的采用逆转录-聚合酶链反应-序列分析方法,对脑炎与非脑炎手足口病患儿粪便和脑脊液样本中肠道病毒71型(EV71)部分VP1区进行核苷酸和氨基酸序列比对,探讨核苷酸或氨基酸变异与不同临床类型的关系。方法以临床诊断和基因诊断方法确定手足口病和EV71感染,用自行设计的2对引物,在EV71 VP1区扩增核苷酸,连接T载体后进行序列分析。所得序列连接后与EV71各亚型和安徽阜阳流行株核苷酸序列,通过DNAMAN和BI-OEDIT软件比对,分析其基因特征,并构建系统发生树。结果 6个不同临床类型手足口病病人核苷酸序列与A型、B型、C型的同源性分别为82.2%～82.6%、82.9%～84.1%和89.1%～95.1%,其中与C4亚型同源性最高,为94.8%～95.1%,与安徽阜阳地区流行株的同源性在98.0%～98.4%之间;与安徽阜阳株氨基酸序列比对,同源性在99.3%～99.6%之间,且均在563位由I(异亮氨酸)变为T(苏氨酸),仅有1例脑炎病人zxuanVP12438-3260(脑脊液)在584位A(丙氨酸)变为G(甘氨酸),1例HFMD病人A06B816064.VP12438-3227(粪便)在736位由W(色氨酸)变为C(半胱氨酸),余未出现特征性改变。结论神经源性肺水肿、脑炎与非脑炎手足口病患儿分离株EV71 VP1区核苷酸序列和推导的氨基酸序列无特征性差异。

• 单位
  山东大学齐鲁儿童医院