基于Illumina高通量测序的岩原鲤转录组分析

作者：赵刚; 龚全; 刘亚; 赖见生; 陈叶雨; 杜军

来源：西南农业学报, 2016, (07): 1743-1749.

DOI：10.16213/j.cnki.scjas.2016.07.043

• 高通量测序
• 岩原鲤
• 转录组 High-throughput sequencing
• Procypris rabaudi
• Transcriptome

为获得岩原鲤转录组信息,发掘功能基因,本研究采用Illumina高通量测序技术对岩原鲤全组织转录组进行测序。结果获得64 257 918个EST序列,经拼接和组装得到83 252条单基因序列(unigene),平均长度787 bp,长度范围201~16 572 bp。利用NCBI的蛋白质非冗余数据库(Nr)对所有unigene进行相似性搜索,共有37 157条unigene(44.63%)与数据库中的已知序列同源。利用Blast2GO v2.5软件对unigene进行注释,共得到29 919条(35.93%)注释基因,根据GO功能分类将其分为生物过程、细胞组分和分子功能3大类56亚类。经KOG...

• 单位
  四川省农业科学院水产研究所