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摘要
目的分析慢性缺氧对胶质母细胞瘤DNA修复基因表达的影响,寻找胶质母细胞瘤潜在的治疗靶点。方法使用limma R包对GEO芯片数据(GSE139250)进行差异计算,利用ggplot包绘制火山图,Gene Oncology与KEGG软件对差异基因的生物过程、分子功能及信号通路进行富集分析,并进一步通过String数据库分析差异表达基因的相互作用网络。结果 GSE139250数据库中180个基因通过差异筛选,7个基因出现差异表达,3个基因表达升高,4个基因表达下调。分子功能富集分析显示上调的3个基因(ABL1、DDB2和EGFR)主要与酪氨酸激酶活性、磷酸酶结合、肌动蛋白丝结合等相关,下调的4个基因(PARP1、ATR、BCL2和LIG4)富集于细胞分化、增殖、凋亡、DNA复制和细胞有丝分裂等;KEGG信号通路分析显示差异表达基因主要与P53信号通路、志贺氏菌、胃癌、结直肠癌、癌症中microRNA等通路相关。结论胶质母细胞瘤慢性缺氧可引起酪氨酸激酶活性、蛋白质磷酸化和肌动蛋白异常,引起细胞DNA复制等过程中DNA损伤及细胞增殖与凋亡等,靶向DNA复制及蛋白质酪氨酸激酶激活和磷酸化过程等分子信号通路可为胶质母细胞瘤提供潜在的治疗靶点。
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