摘要
目的 基于RNA结合蛋白(RNA-binding proteins,RBPs)基因集筛选与甲状腺乳头状癌(papillary thyroid cancer,PTC)患者无进展生存(progression-free survival,PFS)情况有关的预后预测靶标。方法 从UCSC Xena数据库中获取PTC患者的临床病理资料,同时从郑州大学第一附属医院获取行甲状腺手术的PTC患者的癌组织及其配对癌旁(距离癌组织以远2.0 cm处)组织标本。从多个公开数据集的综合分析情况确定PTC癌组织和正常甲状腺组织间差异表达RBPs基因,同时应用Cox单因素和多因素分析来筛选与PFS相关的RBPs基因并从基因和蛋白表达方面对此进行验证;然后进一步采用Cox单因素和多因素分析筛选与PFS相关的影响因素并以此构建可预测PTC患者PFS概率的列线图。结果 (1)本研究从UCSC Xena数据库中共纳入PTC患者424例,从临床收集到30例PTC患者。(2)最终识别出在PTC中7个下调的RBPs基因(KHDRBS2、PPARGC1A、ZFP36L2、SMAD9、ARHGEF28、TDRD9、ZFP36)和3个上调的RBPs基因(ZMAT3、MVP、IGF2BP2)。(3) Cox多因素分析筛选出与PFS相关的1个RBPs基因ZFP36。(4) Western blot法检测临床PTC患者的癌组织中ZFP36蛋白表达情况与在数据库PTC患者的癌组织中的基因表达情况基本一致。(5)将筛选出的与PFS相关的RBPs基因ZFP36与PFS有关的影响因素(T和M分期)用来构建的列线图预测1、3、5年PFS率的受试者工作特征曲线下面积分别为0.80 [95%CI(0.69,0.91)]、0.72 [95%CI(0.62,0.81)]和0.64 [95%CI(0.50,0.77)],列线图的C指数为0.724[95%CI(0.685,0.763)],其3年PFS概率校准曲线与理想对角线非常接近。结论 从本研究数据库资料结合临床病例资料的初步研究结果提示,RBPs ZFP36基因可能是PTC患者的潜在预后靶标。
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