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摘要
CCCH锌指蛋白指含一个或多个由半胱氨酸残基和一个组氨酸残基所组成的基序，是需要锌才能正常行使功能的一类蛋白，在植物生长发育、应答生物及非生物胁迫中发挥重要作用。谷子(Setaria italica L)是一类C4禾本科作物和重要的杂粮作物，目前有关谷子CCCH锌指蛋白的研究还很少。本研究以谷子基因组数据库为基础，利用生物信息学方法对谷子全基因组CCCH基因家族所含成员进行鉴定，并对其进行理化性质分析、系统进化分析、Motif分析、基因结构分析及共线性分析；同时检测了谷子萌发期响应NaCl和干旱胁迫过程中，叶片CCCH家族成员的表达模式。本研究共鉴定出27个谷子CCCH基因家族成员，命名为SiC3H01-27，分布在8条染色体上，共分为14个亚族；27个谷子CCCH基因家族成员的分子量在30593.38～332105.24，蛋白编码124～1393个氨基酸，等电点在4.81～5.24，不稳定指数在31.74～60.12。从27个家族成员中筛选出9个家族成员，并通过实时荧光定量PCR(Quantitative Real-time PCR)操作进行叶片的组织成员表达量分析，在500 mmol/L NaCl胁迫处理下，9个基因均上调表达；在20% PEG干旱胁迫下，2个为下调表达；2个基因同时响应NaCl和PEG处理，4个基因表达量无明显变化。上述差异表达基因为后续深入研究CCCH基因家族对谷子逆境胁迫提供重要依据。
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