基于TCGA数据库的肺腺癌自噬基因预后模型建立与应用

作者：陈彬彬; 叶威^*; 黄约诺; 方涛; 林雪娇; 董晓亭

来源：浙江中西医结合杂志, 2022, 32(04): 311-316.

• 肺腺癌
• 自噬基因
• TCGA数据库
• 预后

目的 利用TCGA数据库建立预测肺腺癌（LUAD）预后的自噬基因（ATG）预后模型。方法 通过R(v3.6.1)软件筛选出TCGA数据库中LUAD样本及癌旁样本中差异表达的ATGs，探讨其潜在功能。进一步筛选预后相关的ATGs，计算各样本的风险值（RS）并构建预后模型，探讨RS与生存、临床特征之间的关系。结果 共筛选出9个生存相关ATGs(RAC1、SQSTM1、CD46、NRG3、IKBKB、VMP1、WIPI1、FKBP1B、IKBKB)。RS是LUAD患者的独立预后因素（P<0.05），高RS与较短的生存期相关（P<0.05）。结论 9个自噬基因构建的自噬预后风险模型，可以用来预测LUAD患者预后情况。

• 单位
  浙江中医药大学附属温州市中医院