利用小RNA测序技术检测贵州西番莲病毒

作者：严佳文; 袁启凤; 解璞; 王立娟; 马玉华^*; 王正媛

来源：热带作物学报, 2019, 40(08): 1577-1584.

• 西番莲
• 病毒
• 小RNA测序
• 鉴定

病毒病害是西番莲重要病害之一,明确病毒种类可为病害防治提供理论依据。本研究应用小RNA测序技术对6份疑似病毒侵染的西番莲叶片样本进行病毒种类鉴定,发现混合样本中含有黄瓜花叶病毒(Cucumbermosaicvirus,CMV)和夜来香花叶病毒(Telosma mosaic virus, TeMV)。应用RT-PCR分别扩增6份样本中2种病毒的外壳蛋白(coat protein, CP)基因序列,进一步证实6份样本中均含有CMV和TeMV。CMV的CP基因开放阅读框大小为657 bp,与已报道的其他分离物的一致性为82.3%～95.9%;TeMV的CP基因开放阅读框为816 bp,与其他分离物的一致性分别为87.8%～99.3%和87.8%～98.3%。上述结果表明,贵州西番莲中的病毒是CMV和TeMV的分离物,分别命名为CMV-GZ(CP基因登录号为MH623077)、TeMV-GZ1(MH623078)和TeMV-GZ2(MH623079)。

• 单位
  贵州省农业科学院