雌激素受体阳性绝经后肥胖乳腺癌的芯片数据分析

作者：陈路嘉; 朱彦辉; 姚广裕; 胡晓磊; 伊曼; 黄萍妹; 叶长生^*

来源：广州医科大学学报, 2018, 46(03): 12-19.

• 乳腺癌
• 雌激素受体阳性
• 绝经后
• 肥胖
• 基因差异表达谱

目的:初步探索雌激素受体(ER)阳性绝经后肥胖乳腺癌的相关基因及可能涉及的信号通路。方法:从GEO公共数据库下载含体质指数(BMI)信息的ER阳性绝经后乳腺癌基因芯片数据集(GSE70947),共获得13例肥胖乳腺癌和38例非肥胖乳腺癌的基因表达谱数据,进行基因差异表达谱和信号通路分析,并通过荧光定量PCR法和Western blotting检测法进行相关验证。结果:基因芯片数据分析显示,566个基因在肥胖乳腺癌中出现差异表达,分别有342个基因上调和224个基因下调。GO分析和Pathway分析发现,细胞功能和信号通路可能参与了ER阳性绝经后肥胖乳腺癌的发生发展过程。荧光定量PCR检测结果显示,MMP14、SLC26A3、COL1A2基因mRNA表达情况与芯片分析结果一致。Western blotting检测结果显示,肥胖乳腺癌的COL1A2蛋白相对表达量更高(P<0.05)。结论:本研究分析了ER阳性绝经后肥胖乳腺癌的基因表达谱及可能涉及的信号通路,其中COL1A2基因可能是ER阳性绝经后肥胖乳腺癌的相关基因及潜在的治疗靶点。

• 单位
  南方医科大学南方医院