摘要
由于技术的快速发展和成本的大幅降低, 宏基因组下一代测序(metagenomic next-generation sequencing, mNGS)的应用正在从研究转向临床实验室。尽管许多研究和病例报告已经证实mNGS在改进传染病的预防、诊断、治疗和追踪方面取得了成功, 但仍有一些障碍必须克服。mNGS的结果会展示样本中的全部可能病原体, 然而面对着数千种会感染人类的微生物, 如何准确判读其中关键致病病原体是具有挑战性的。迄今为止, 在临床实践中, mNGS的解读标准也尚未统一。本文就mNGS在不同系统中病原体感染的结果解读, mNGS结果的临床解读和应用规则, 以及mNGS解读在病原体诊断中面临的挑战进行阐述。