基于MALDI-TOF MS的弧菌识别能力分析

作者:张慧芳; 李莉; 麻丽丹; 张建中; 肖迪
来源:中国病原生物学杂志, 2016, 11(06): 522-534.
DOI:10.13350/j.cjpb.160610

摘要

目的确定基质辅助激光解析飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)-Biotyper系统对弧菌属细菌的识别能力。方法采用Bruker Microflex LT系统,通过构建30株弧菌的肽质量参考谱库、完善Biotyper数据库;采用77株弧菌对数据库的识别能力进行评价;采用主谱图预测聚类分析揭示其对弧菌属、种水平的区分能力及肽质量谱与菌株毒力的相关性。结果 107株弧菌通过MALDI-TOF MS-Biotyper原数据库系统鉴定,92.5%(99株)为属水平识别,55.1%(59株)为种水平识别。用于外部验证的77株菌搜索Biotyper原数据库和补充完善后的数据库,种水平识别率从53.2%提高至96.1%,提高42.9%;属水平识别率从92.2%提高至100%,提高7.8%;聚类分析显示弧菌属中麦氏弧菌与溶藻弧菌、弗尼斯弧菌肽质量谱特异性差,是造成识别错误的主要因素;聚类信息显示,肽质量谱与霍乱弧菌的产毒性不相关,与副溶血性弧菌毒力不相关。结论 MALDI-TOF MS-Biotyper系统可用于弧菌属、种水平的快速识别。数据库的完善程度是决定种水平识别能力的关键。

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