Slit2在膀胱癌中的表达、信号通路及其与患者预后关系的生物信息分析

作者：李扬; 王云; 李遵; 朱朝阳^*

来源：河南大学学报(医学版), 2021, 40(01): 19-24.

DOI：10.15991/j.cnki.41-1361/r.2021.01.004

• 膀胱癌
• 生物信息
• Slit2基因
• 预后
• 信号通路

[目的]探讨Slit2在膀胱癌中的表达及其与患者预后关系。[方法]采用生物信息学方法,在GTEx数据库中检索Slit2基因在人体各种组织中的表达水平,在TCGA数据库中分析Slit2多种肿瘤组织及在膀胱癌中的表达。采用在线分析工具cBioPortal,分析Slit2基因突变情况。根据Slit2表达水平,分为高、低表达组,比较两组患者无疾病进展生存(DFS)和总生存(OS)是否存在差异。[结果]Slit2基因mRNA在膀胱癌患者癌组织中的表达水平明显高于癌旁正常膀胱组织(P<0.05),且Slit2表达水平与患者临床分期有关,分期越高表达水平越高(P<0.05)。Slit2基因主要突变形式为融合突变、扩增突变、深度缺失突变和多重突变等。其中缺失突变占25.55%,同义突变占8.19%,无意义突变占2.01%。单核苷酸突变主要类型为C>T(28.51%)、G>T(13.64%)和C>A(9.85%)。STRING数据库中构建Slit2相关基因蛋白网络,网络中共有21个相关基因,基因间的联系为92,平均节点相关度为8.76,区域聚类指数为0.776,相关蛋白网络富集明显(P<0.001)。蛋白网络相关基因KEGG信号通路主要富集于Ras信号通路、T细胞受体信号通路、Rap1信号通路和ErbB信号通路等。Slit2高低表达膀胱癌患者无疾病进展生存(DFS)和总生存(OS)间均存在明显的差异(P<0.05)。无疾病进展生存(DFS)(HR=1.5,P=0.026)和总生存(OS)(HR=1.50,P=0.015),在Slit2高表达组患者显著低于低表达组,提示Slit2高表达是膀胱癌预后不良的因素。[结论]Slit2基因在膀胱癌患者癌组织中表达水平明显上调,高表达与膀胱癌患者的预后不良有关。

• 单位
  河南大学淮河医院