探究染色质调节因子在胃癌进展中的作用及潜在治疗靶点

作者：马梦璇; 张燕飞; 祁玉娟^*

来源：实用药物与临床, 2023, 26(06): 488-493.

DOI：10.14053/j.cnki.ppcr.202306002

• 胃癌
• 差异表达基因
• 生物信息学
• 核心基因

目的 探讨染色质调节因子(Chromatin regulators, CRs)在胃癌(Gastric cancer, GC)患者中的功能、预后价值及潜在治疗靶点。方法 采用GEO数据库中的GEO2R在线分析工具对微阵列数据研究集GSE26942和GSE79973进行差异基因分析，与染色质调节因子基因集取交集基因获得差异基因，对差异基因进行差异基因本体分析(Gene ontology, GO)与KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)富集分析。通过String(蛋白相互作用分析数据库)构建差异基因的蛋白相互作用网络，使用Cytoscape软件中的cytoHubba插件获得hub基因(中枢节点基因),构建hub基因胃癌预测模型，绘制列线图、校准曲线(Calibration curve)及受试者工作特征曲线(ROC,Receiver operating characteristic curve)曲线，并预测潜在治疗药物。结果 生物信息学分析显示，GSE26942和GSE79973中染色质调节因子有137个差异基因，其中上调基因93个，下调基因44个。采用cytoHubba插件获得hub基因为BRCA2、BARD1、RAD51、NBN、PCNA、TP53BP1、E2F6、RUVBL1、RUVBL2、WDR5,在胃癌的预测模型中，RUVBL1基因的预测性最佳。并根据hub预测相关潜在治疗药物有氟达拉滨、硝酸钾等。结论 染色质调节因子在胃癌发生发展中起重要作用，并找到胃癌的预测基因及潜在治疗药物。

• 单位
  青海省人民医院; 青海大学