一株人轮状病毒G2P[4]型毒株的近似全基因组进化分析

作者：高升辉; 李利利; 李丹地; 朱曦; 王萌璇; 王明雯; 吴建军; 李金松^*

来源：中华实验和临床病毒学杂志, 2022, 36(04): 402-408.

• 轮状病毒
• G2P[4]基因型
• 全基因组
• 系统进化树

目的分析轮状病毒G2P[4]型2020BJ株的近似全基因组进化特征。方法运用逆转录-聚合酶链式反应(reverse transcription-polymerase chain reaction, RT-PCR)进行轮状病毒基因组扩增, 将扩增产物测序, 对所得序列进行系统进化和同源性分析。结果获得人轮状病毒G2P[4]型2020BJ株近似全长的11个节段核酸序列, 序列分析表明其为G2-P[4]-I2-R2-C2-M2-A2-N2-T2-E2-H2基因型(DS-1-Like);进化分析表明与日本、印度、孟加拉及意大利等国家毒株亲缘关系较近;亲缘关系较近的毒株间抗原表位的氨基酸存在差异。结论与2020BJ亲缘关系较近的5株G2P[4]型轮状病毒VP7和VP4的抗原表位的氨基酸存在差异, 可能导致流行特征不同, 应加强轮状病毒监测。

• 单位
  公共卫生学院; 甘肃中医药大学; 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所