藜芦属药用植物的叶绿体基因组比较分析和系统发育研究

作者：田星; 刘莹莹; 张颖敏; 杨从卫; 钱子刚; 李国栋

来源：中草药, 2022, 53(04): 1127-1137.

DOI：10.7501/j.issn.0253-2670.2022.04.021

• 藜芦属
• 叶绿体基因组
• 高通量测序
• 序列变异
• 系统发育

目的 以藜芦属药用植物蒙自藜芦Veratrum mengtzeanum、大理藜芦V. taliense、狭叶藜芦V. stenophyllum和毛叶藜芦V.grandiflorum为材料，对其叶绿体基因组进行组装和序列分析。方法 采用高通量测序技术对4种植物叶绿体基因组进行测序，并且使用NOVOPlasty和GeneiousR11软件分别组装和注释序列，在此基础上进行基本结构和系统发育分析。结果 藜芦属4种植物叶绿体基因组具有典型的环状四分体结构，全长151 875～153 711 bp，总GC含量37.7%～37.8%。藜芦属叶绿体基因组均注释到135个基因，其中蛋白质编码基因83～84个，r RNA基因8个和t RNA基因38个。通过比较发现，4种植物IR区边界未出现明显的扩张或收缩；毛叶藜芦叶绿体基因组序列较保守，变异位点少；蒙自藜芦、大理藜芦和狭叶藜芦序列变异较大，种间差异较小；此外，在一个大单拷贝区（large single copy region,LSC）和小单拷贝区（small single copy region,SSC）区筛选到13个高变片段。系统发育研究表明，毛叶藜芦与蒙自藜芦、大理藜芦和狭叶藜芦亲缘关系较远，后两者亲缘关系最近。结论 对藜芦属4种植物叶绿体基因组结构和系统发育关系进行了分析，为后续开展分子鉴定及群体遗传学研究提供了数据资料。

• 单位
  云南中医药大学