2016-2017年中国部分地区TTSuV2流行情况调查与遗传进化分析

作者：王德海; 陈文文; 朱金海; 李春秋; 李鹏^*; 孙东波^*

来源：黑龙江八一农垦大学学报, 2022, 34(06): 45-76.

• 猪细环病毒2型
• 流行情况
• 遗传演化分析

为了解2016-2017年中国地区TTSuV2的流行情况以及流行毒株的遗传演化情况，对中国东北、华中、华东、华北、华南、西南、西北7个地区采集的325份仔猪腹泻样品进行PCR检测，并对其中阳性样品的基因组高变区进行克隆与遗传演化分析。结果显示：TTSuV2阳性样品总数为92份，总阳性率为28.31%；成功克隆出目的基因31条，均属于Kappatorquevirus属的TTSuV k2a基因型，且分布于Group1和Group2。基于全长目的基因同源性分析结果显示，31株TTSuV2型鉴定毒株之间的核苷酸同源性为87.5%～99.7%。UTR核苷酸序列比对结果显示，所有鉴定毒株的核苷酸突变位点主要集中在第51～230 nt。ORF2蛋白序列比对结果显示，所有鉴定毒株的氨基酸突变位点主要集中在第39～49 aa;ORF1蛋白序列比对结果显示，氨基酸突变位点主要集中在第19～50 aa。重组分析结果显示，共存在1株潜在重组毒株TTSuV/515。ORF2基因选择压力分析结果显示，3个密码子位点受到正选择压力，4个密码子位点受到负选择压力。

• 单位
  动物科技学院; 黑龙江八一农垦大学