六价铬致BEAS-2B细胞DNA损伤修复基因转录组学特征分析

作者:哈飞再; 郑湃; 冯慧敏; 苏泽康; 胡贵平; 王天成*; 贾光*
来源:毒理学杂志, 2021, 35(04): 289-305.
DOI:10.16421/j.cnki.1002-3127.2021.04.005

摘要

目的研究六价铬暴露对细胞DNA损伤修复相关基因的影响。方法将人支气管上皮细胞系(BEAS-2B)暴露于0.20、0.60、1.80μmol/L六价铬24 h,提取RNA进行转录组学的测定。分析得到不同剂量组的差异表达mRNA并与AmiGO 2数据库进行比对,提取并分析DNA修复相关基因的差异表达、功能、互作网络及候选基因。结果六价铬染毒后共得到3 959个差异基因,其中下调基因共有2 928个,上调基因有1 031个。在不同染毒剂量下,低、中和高染毒组各有506、981以及2 472个差异基因。对提取的DNA修复相关基因分析的结果显示,SMC1A基因在3个剂量组中均差异表达;有11个基因在中、高剂量组中均差异表达,其中有3个基因参与DNA双链断裂的修复,分别为BRCA2、RAD51B和PRKDC,在高剂量组中与对照组差异表达的倍数分别为0.70(P=0.005)、0.19(P=0.003)和0.52(P=0.007);MGME1基因涉及线粒体DNA的修复,相对于对照组,中、高剂量组表达改变倍数为0.75(P<0.001)、0.67(P=0.025)。结论六价铬染毒后DNA部分修复基因表达发生了改变,其中DNA双链断裂修复相关基因BRCA2、RAD51B和线粒体DNA修复基因MGME1可作为进一步研究的候选基因。

全文