番茄CRT基因家族鉴定及不同胁迫下响应分析

作者：蔡智博; 王傲雪^*

来源：分子植物育种, 2021, 19(22): 7359-7366.

DOI：10.13271/j.mpb.019.007359

• 番茄
• CRTs基因
• 生物信息学分析
• 逆境胁迫

为探究番茄CRT基因家族成员信息和在不同胁迫下的响应情况,本研究以拟南芥CRT氨基酸序列为参照,通过tblastn方法共发掘出3个番茄CRT基因,其氨基酸长度在413 aa到433 aa之间,分子量在47.6 kD到50.9 kD之间;构建系统进化树发现,番茄CRT基因家族可分为两个亚族,CRT3和CRT4为同一亚族;亚细胞定位结果表明,番茄CRT基因主要存在于细胞核和内质网上;基因结构分析说明番茄CRT基因家族成员都富含内含子;对番茄CRT基因家族成员启动子上游2 000 bp碱基分析发现,番茄CRT基因家族可能会响应多种逆境胁迫,同时番茄CRT可与多种蛋白互作;通过RT-qPCR发现,CRT基因在各组织当中表达含量会有所差异,且番茄CRTs对各种胁迫反应都能做出相应反应。本研究结果对后续解析CRT基因在番茄中的生物学功能奠定了基础。

• 单位
  东北农业大学; 生命科学学院