血红丛赤壳属交配群Ⅵ全基因组候选效应分子的预测和分析

作者：戚家明; 张东旭^*; 王少丽; 王阳; 肖建中^*

来源：浙江农业科学, 2021, 62(01): 106-110.

DOI：10.16178/j.issn.0528-9017.20210137

• 血红丛赤壳属交配群Ⅵ
• 效应分子
• 基因组
• 生物信息学

血红丛赤壳属交配群Ⅵ(Nectria haematococca mating populationⅥ)是茄镰孢豌豆专化型(Fusarium solani f. sp.pisi)的有性态,由其引起的豌豆镰孢根腐病是豌豆上最重要的病害之一。对该菌候选效应分子进行预测,并对其特征进行明确。通过全基因组测序获得Nectria haematococca mpⅥLQ1菌株全基因组信息,利用Signal P、TMHMM、Protcomp、big-PI Predictor和Target P等生物信息学软件和预测程序对其中9 912条蛋白序列进行候选效应分子预测,再通过对上述蛋白半胱氨酸含量、信号肽长度和冗余性分析,获得229个符合条件的候选效应分子,其中大部分为功能未知的假定蛋白。利用生物信息学方法预测出血红丛赤壳属交配群ⅥLQ1的候选效应分子,为进一步研究血红丛赤壳属交配群Ⅵ的致病机制奠定了基础,并为其他病原菌效应分子的预测与分析提供了参考。

• 单位
  丽水学院