海南文昌海域珊瑚非培养共附生放线菌的多样性

作者:李芬发; 周双清; 许云; 吴文嫱; 夏薇; 张荣萍; 黄东益; 黄小龙*
来源:基因组学与应用生物学, 2021, 40(Z4): 3528-3537.
DOI:10.13417/j.gab.040.003528

摘要

本研究旨在探究海南文昌海域稀杯盔形珊瑚(Galaxea astreata)、角蜂巢珊瑚(Favites complanata)、滨珊瑚(Porites lichen)、瘿叶蔷薇珊瑚(Montipora aequituberculata)以及叶状蔷薇珊瑚(Montipora foliosa)共附生放线菌物种多样性。本研究提取珊瑚样品总DNA以扩增16S rRNA基因的V3-V4高变区,通过Miseq高通量测序对珊瑚的共附生放线菌群落结构和多样性进行研究分析。结果表明,6个珊瑚样品中存在丰富的放线菌类群,选取的放线菌门序列归为656个不同的OTU,包括放线菌门下的6个纲,19个目,33个科以及50个属。此外在6个珊瑚样品中均检测到大量的未知类群,有407个OTU没有指定到已知的分类水平,其中最高的是叶状蔷薇珊瑚及其共附生放线菌文库,未分类的属达到了94.17%,很可能代表着新的放线菌类群。多样性指数分析结果显示,稀杯盔形珊瑚的共附生微生物丰度和多样性水平最高,叶状蔷薇珊瑚为最低。本研究发现,珊瑚样品之间存在明显的共附生放线菌类群差异性,这种差异性不仅存在于珊瑚的种类之间,也表现在同种珊瑚的个体之间。

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