基于转录组测序分析内蒙古绒山羊毛囊退行期与休止期差异表达基因

作者：苏蕊; 刘燕; 范一星; 乔贤; 李晓凯; 张磊; 丽春; 何利兵; 王瑞军; 李金泉^*

来源：黑龙江畜牧兽医, 2018, (17): 67-75.

DOI：10.13881/j.cnki.hljxmsy.2018.01.0035

• 内蒙古绒山羊
• 毛囊
• 转录组测序
• 退行期
• 休止期
• 差异表达基因

为了探究内蒙古绒山羊次级毛囊(SHF)退行期到休止期以及相应时间点的初级毛囊(PHF)的差异表达基因,试验对3只内蒙古绒山羊阿尔巴斯型2周岁成年母羊的退行期和休止期的初、次级毛囊进行转录组测序,并采用生物信息学方法分析数据;在检测测序质量合格的基础上,进行差异表达基因的筛选、GO功能富集和KEGG通路富集分析。结果表明:在次级毛囊中,退行期(1月份)与休止期(3月份)分别对比到50 626个和50 628个转录本,其中1 199个差异表达基因中有953个上调基因和246个下调基因;初级毛囊在这两个时间点分别比对到50 629个和50 626个转录本,其中1 977个差异表达基因中有1 258个上调、719个下调;这两个时期中,共有100个差异表达基因同时比对到初级毛囊与次级毛囊中。GO功能富集结果显示,次级毛囊两个时期的差异表达基因主要富集在肌肉重建、肌丝滑动等功能上;初级毛囊两个时期差异表达基因主要富集在翻译延伸、转录拼接等功能上。

• 单位
  内蒙古农业大学; 内蒙古民族大学; 动物科技学院; 农业部; 动物科学学院