沙眼衣原体多形态膜蛋白D基因序列分析及其B细胞抗原表位预测

作者：刘光桥; 宋立华; 邱少富; 端青

来源：微生物学免疫学进展, 2008, (03): 24-28.

DOI：10.13309/j.cnki.pmi.2008.03.006

• 沙眼衣原体
• 多形态膜蛋白D
• 二级结构
• B细胞表位
• 预测 Chlamydiat rachomatis
• Polymorphic membrane protein D
• Secondary structure
• B cell epitopes
• Prediction

分析沙眼衣原体多形态膜蛋白D(PmpD)的基因序列并预测PmpD蛋白的B细胞抗原表位。在GenBank中检索沙眼衣原体不同血清型的PmpD基因序列,进行序列比对分析。以L2血清型PmpD基因序列为材料,采用Karplus-Schulz、Chou-Fasman和Gamier-Robson方案预测蛋白质的二级结构和柔性区;按Jamesonv-Wolf方案预测抗原指数,运用Kyte-Doolittle方案预测PmpD氨基酸的亲水性,利用Emini方案预测蛋白质的表面可及性。检索到20个沙眼衣原体不同菌株的PmpD基因序列,分析发现其核苷酸序列非常保守,一致性高达99.14%~100%;对预测结果综合...

• 单位
  病原微生物生物安全国家重点实验室; 军事医学科学院