猴源DDX3X基因的克隆及生物信息学分析

作者：杨洪; 田浪; 张升波; 张喜懿; 温贵兰^*; 程振涛; 王开功; 周碧君

来源：贵州农业科学, 2019, 47(12): 70-75.

• DDX3X基因
• 猴源肾细胞
• T克隆
• 生物信息学分析

为猴源DDX3X基因与相关病毒作用机理的深入研究奠定基础,根据Gen Bank预测的猪源DDX3 X基因序列(登录号HQ266638)设计合成特异性引物,采用RT-PCR从猴源肾细胞中扩增DDX3X基因,将其克隆至pMD-19T载体测序,并对其进行生物学特征分析。结果表明:克隆的猴源DDX3 X基因全长1 989bp,与猕猴的核苷酸序列同源性达99.6%,与绿猴、猕猴和人并列在同一遗传进化分支上,与三者的一致性较高;蛋白编码有662个氨基酸,共计20种氨基酸;甘氨酸含量最高,为11.5%,理论等电点为6.73;猴源DDX3X基因含有DEAD-Like解旋酶超家族结构域和C端结构域,DDX3X蛋白具有良好的亲水性,二级、三级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主。猴源DDX3 X基因与多个调节细胞进程、RNA加工的关键蛋白存在相互作用。

• 单位
  动物科学学院; 贵州大学