基于转录组测序的地黄次生代谢后修饰相关基因的挖掘与分析

作者:朱畇昊; 赵乐; 董诚明; 郑晓珂; 冯卫生
来源:2016首届中国中药资源大会暨CSNR中药及天然药物资源研究专业委员会第十二届学术年会.

摘要

  本研究通过高通量测序技术构建地黄脱毒苗转录组数据库,共得到13.61Gb的干净数据,De novo组装后共获得70,778条Unigene,其中有33.428(47.23%)条unigenes能被Nr,Swiss-Prot,Pfam,KOG, KEGG, GO and COG等公共数据库注释.进一步对被注释的地黄萜类生物合成及后修饰相关基因进行挖掘发现,地黄转录组中共有81个Unigene参与萜类骨架合成;共有226个Unigene可能参与CYP450介导的环烯醚萜骨架的氧化修饰;共有102个Unigene与糖基转移酶相关.地黄转录组数据库的获得为探索地黄环烯醚萜类成分的生物合成研究奠定了基础,为后续基因功能的分析等研究提供分子水平依据.

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