DNA条形码(ITS2)在葫芦科鉴定中应用价值的评估

作者：唐银琳; 刘镛; 姚辉; 陈振东; 吴耀生; 徐鹏; 蒋东

来源：植物科学学报, 2012, (06): 631-638.

• 葫芦科
• ITS2
• 鉴定
• 应用价值
• 纳入标准 Cucurbitaceae
• ITS2
• Identification
• Application value
• Inclusion criteria

探讨在纳入分析数据时,数据信息的选择对ITS2序列作为DNA条形码在葫芦科植物中鉴定能力的影响。首先,建立由葫芦科植物ITS2序列组成的3个资料组,其中Dataset1为实验样本,Dataset2由实验样本及Gen-Bank数据库样本组合,Dataset3为从Dataset2中去除部分序列后所得。通过比较3个资料组的种间、种内的变异、Barcoding Gap及鉴定成功率,评估纳入分析的数据选择差异对ITS2鉴定能力的影响。结果显示ITS2序列在3个资料组属水平上的鉴定成功率均达到100%;种水平上,用BLAST1法鉴定成功率分别为100%、67.8%、90.6%,Nearest Distan...

• 单位
  中国医学科学院药用植物研究所; 广西医科大学; 广西壮族自治区农业科学院蔬菜研究所