基于膀胱尿路上皮癌免疫相关基因预后模型的建立与验证

作者：单卫民; 管波^*

来源：现代泌尿生殖肿瘤杂志, 2021, 13(06): 325-329.

• 膀胱尿路上皮癌
• 分子标签
• 免疫相关基因

目的 通过挖掘癌症基因组图谱(TCGA)数据库中膀胱尿路上皮癌(BLCA)免疫相关基因(IRGS)数据，构建BLCA预后分子标签，为BLCA精准治疗提供新的预后模型。方法 下载TCGA数据库中BLCA患者的临床数据以及BLCA转录组数据，筛选出IRGS表达数据，并计算出正常膀胱组织与BLCA组织表达差异显著的IRGS,然后随机抽取70%数据应用Lasso-Cox回归构建预后分子标签，30%数据用于验证构建的IRGS分子标签。结果 下载的数据共包含412例患者；在Immport数据库中下载IRGS资料，使用R语言的limma包在BLCA组织中筛选出差异表达的IRGS 303种；再将412例患者肿瘤组织样品数据按30%和70%随机分为两组，70%组为训练组，用于筛选预后分子标签；30%组为测试组，用于测试筛选出的分子标签预测预后效果；联合临床预后数据采用Lasso-Cox回归分析从中筛选出5种与BLCA预后IRGS,分别为ADCYAP1R1、APOBEC3H、OAS1、PTGER3、SH3BP2,并联合5种IRGS构建预后分子标签：评分风险(Risk score)=0.101 31×EXPADCYAP1R1-0.137 76×EXPAPOBEC3H-0.158 94×EXPOAS1+0.091 75×EXPPTGER3-0.186 48×EXPSH3BP2。结论 通过对TCGA数据库的挖掘，发现对BLCA预后有影响的5种IRGS,且联合5种IRGS构建的分子标签与BLCA患者的预后有显著性关联，为BLCA精准治疗提供了新的预后模型。

• 单位
  阜阳市人民医院