湖泊生态环境治理是一项系统性工程，筛选出科学合理的治理方案对湖泊治理工作至关重要。针对湖泊生态环境治理的整体性要求，建立包括水动力、水质和水生态环境3种因素在内的湖泊生态环境治理方案筛选体系，提出湖泊生态环境治理方案筛选方法。以芽庄湖为研究对象，提出优化补水、优化污水治理、优化补水+提高治污力度3种方案，对水动力和水质进行模拟，对比不同方案的治理效果。结果表明，方案3对理想解的贴近度最高，为0.84,也即方案3对水动力、水质和水生态环境的改善效果最好。
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