细粒棘球绦虫水通道蛋白基因家族成员密码子偏好性分析

作者：范俊杰; 吴宏烨; 李锴; 叶彬^*

来源：基因组学与应用生物学, 2020, 39(06): 2832-2841.

DOI：10.13417/j.gab.039.002832

• 细粒棘球绦虫
• 水通道蛋白
• 密码子偏好性
• 非洲爪蟾卵母细胞
• 酵母

水通道蛋白(aquaporin, AQP)是一种主要内在蛋白家族成员,具有通透水及其他小分子溶质的功能,参与虫体渗透稳态、物质转运等过程。本研究运用CodonW、SPSS等生物信息学软件分析细粒棘球绦虫(Echinococcus granulosus)水通道蛋白基因家族成员(EgAQPs)的密码子使用偏好性,并与非洲爪蟾(Xenopus laevis)卵母细胞、酵母(Saccharomyces cerevisiae)进行密码子偏好性比较,以期找到EgAQPs最合适的外源表达系统。结果表明EgAQPs密码子选用偏好性普遍较弱,偏好以C/G作为结尾。在密码子使用频率上,EgAQPs与非洲爪蟾卵母细胞的差异高于酵母,表明酵母表达系统可能更适合于EgAQPs表达。若要进一步提高EgAQPs在非洲爪蟾卵母细胞或酵母中的表达水平,尚需对其密码子进行优化。

• 单位
  重庆医科大学