大蒜全基因组NCED基因鉴定与功能初探

作者:袁晓戈; 李富; 张雪钰; 曾铮; 何巧芸; 周智满; 王延周; 杨喜爱*; 刘头明*
来源:中国蔬菜, 2023, (03): 47-56.
DOI:10.19928/j.cnki.1000-6346.2023.2012

摘要

采用生物信息学方法,从大蒜基因组中共鉴定出AsaNCED基因14个,预测其氨基酸数量为409~599个,蛋白分子量为46 421.95~67 090.27 Da,理论等电点为5.48~6.87。多数基因外显子数为1个,少数为11~12个。在启动子顺式作用元件中,光、脱落酸和茉莉酸甲酯响应元件在数量上占据优势,并广泛分布在不同的基因家族成员中;同时也存在与干旱相关的MYB结合位点、防御与胁迫响应元件、伤口响应元件和种子特异性调控元件。该基因家族成员在不同组织中具有一定的表达差异性。通过异源过表达AsaNCED4获得转基因拟南芥,其株高明显低于野生型,qRT-PCR分析发现AsaNCED4基因受盐胁迫诱导上调表达。

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