迁移体相关基因在人肝癌发展过程的作用机理研究

作者：赵忠扩; 陆飞; 董锐; 张波

来源：基因组学与应用生物学, 2023, 1-18.

• 肝癌
• 迁移体
• 标志基因
• 生物信息学

迁移体（Migrasome）是由迁移细胞产生的细胞器，在胚胎发育、机体免疫反应和肿瘤转移等细胞生物学行为过程中发挥信号转导作用，然而其在人（Homo sapiens）肝癌中的作用尚不清楚。为了探究迁移体相关基因对肝癌患者恶性进展及临床预后的影响，采用TCGA数据库分析迁移体相关标志基因TSPAN4、TSPAN7、KIF5B、MYO19、DNM1L mRNA表达水平；绘制Kaplan-Meier曲线分析上述基因对肝癌患者临床预后的影响；利用临床生信之家（assistant for clinical bioinformatics， ACLBI）网站进行GO和KEGG富集分析；运用STRING数据库平台及Cytoscape软件开展蛋白质相互作用（protein-protein interaction， PPI）核心网络分析。在人肝癌细胞SMMC7721、Huh7中转染合成siRNA，用CCK8法评估转染TSPAN4后细胞增殖能力的改变；采用免疫荧光染色法检测细胞中TSPAN4蛋白的表达分布；采用碘化丙啶（propidium iodide， PI）单染法检测细胞周期分布；采用划痕伤口愈合实验和transwell实验检测TSPAN4后细胞迁移能力的改变。结果显示，TSPAN4、TSPAN7、KIF5B、MYO19、DNM1L mRNA在肝癌与癌旁组织中表达差异均有统计学意义（FDR<0.001），其中TSPAN4、MYO19、DNM1L mRNA表达影响肝癌患者的预后，差异有统计学意义（P<0.05）。TSPAN4、TSPAN7、KIF5B、MYO19、DNM1L mRNA表达影响肝癌患者多项基因表达水平，其中迁移体的最主要标志基因TSPAN4与多项免疫相关细胞增殖、脂代谢、氨基酸代谢等功能相关（FDR＜0.05），并参与细胞黏附分子、细胞周期、细胞衰老等信号通路（FDR＜0.05）。敲低TSPAN4表达抑制人肝癌细胞SMMC7721和Huh7细胞增殖能力，并使其处在G2/M期细胞的百分比增加，敲低TSPAN4表达抑制人肝癌细胞SMMC7721和Huh7细胞的迁移能力。本研究证明迁移体相关标志基因与肝癌患者预后相关，TSPAN4 mRNA表达影响肝癌细胞增殖、迁移及细胞周期。

• 单位
  浙江大学