摘要
脂肪氧合酶(Lipoxygenase, EC1.13.11.12, 简称LOX)是一种氧化还原酶,通常被认为是一类含有非血红素铁的蛋白质,能催化植物体内酚基甘油酯产生脂肪酸衍生物。另外,现有研究表明,脂氧合酶途径与植物的生长发育及抗逆反应密切相关。槲树是优良的绿化树种,能够抵抗多种不良环境。为了进一步研究槲树LOX基因家族的功能,本研究利用生物信息学工具,系统地对槲树基因组中LOX基因家族成员进行鉴定,并对其进化关系、基因结构、蛋白质理化性质和保守基序、共线性分析以及顺式作用元件和组织特异性表达进行分析。结果表明,槲树全基因组中鉴定出18个LOX家族基因,命名为QdLOX1~QdLOX18;根据系统发育树可以将LOX基因分为2个亚家族(9-LOX, 13-LOX),各基因成员分布于6条染色体上,其中2对基因存在串联复制现象;保守基序分析表明,槲树LOX家族蛋白的保守基序具有很高的保守性;共线性分析表明,大部分同源基因结构具有相似性;转录组结果表明,QdLOX2基因在根、茎和叶中高表达。本研究结果表明槲树LOX基因家族发生了扩张,为进一步研究LOX基因家族与木本植物生长发育及抗逆反应的关系提供理论依据。
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