为了更好地保障电子商务支付的安全性,提出基于SET协议的电子商务支付安全加密方法。结合密钥加密技术设计了电子支付安全协议,进一步结合二层神经网络原理对电子商务支付安全加密算法进行改进和优化,进而保证电子商务支付的安全性,实现基于SET协议的电子商务支付安全加密方法的合理设计。最后通过实验证实,基于SET协议的电子商务支付安全加密方法具有更高的安全性和有效性,充分满足研究要求。