上海市黄浦区2013—2016年麻疹病毒分离株核蛋白基因特征分析

作者：宋黎黎; 王静; 褚维; 王宇; 陈军; 李崇山^*

来源：国际病毒学杂志, 2018, 25(06): 408-411.

• 麻疹病毒
• 核蛋白类
• 基因型
• 序列分析

目的分析上海市黄浦区2013—2016年麻疹病毒分离株核蛋白基因特征。方法 2013—2016年上海市黄浦区麻疹实验室共采集72例疑似麻疹病例咽拭子标本, 用Vero/hSLAM细胞进行病毒分离, 经real-time RT-PCR方法鉴定为阳性的麻疹病毒分离株, 采用RT-PCR方法扩增麻疹病毒N基因核苷酸片段(450 bp), 对扩增产物进行序列测定和基因特征分析。结果 72例疑似麻疹病例中分离到40株麻疹病毒。40例阳性病例中, 男性23例(57.5%), 女性17例(42.5%), 年龄为(19.07±16.52)岁。40株麻疹病毒的基因亲缘关系显示, 39株为H1基因型中的H1a基因亚型, 并且有2个明显分支, 另外1株为B3基因型。39株H1a基因型麻疹病毒株与同型参考株MVi/Hunan.CHN/0.93/7(AF045212)的核苷酸和氨基酸同源性分别为97.8%～100.0%和96.6%～100.0%。结论 H1a基因亚型是上海市黄浦区2013—2016年本地麻疹流行的优势基因亚型, 同一年份存在着不同的传播链。分离的病毒株在核苷酸和氨基酸序列水平上高度保守, 关键功能位点未发生变异。

• 单位
  上海市疾病预防控制中心; 上海市黄浦区疾病预防控制中心