2015年～2021年我国东部地区猪流行性腹泻病毒S1蛋白关键表位的变异分析

作者：程亚豪; 胡灵子; 刘雅琦; 周莹珊; 杜静; 周兴东; 王晓杜; 吴瑗^*; 董婉玉^*

来源：中国预防兽医学报, 2023, 45(09): 968-972.

• 猪流行性腹泻病毒
• S1基因
• 遗传变异
• 序列分析

为了解2015年～2021年我国东部地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)的流行特征和遗传变异规律，本研究利用RT-PCR扩增2015年～2017年11株分离自浙江地区PEDV流行株的S1基因序列，并与GenBank中我国东部地区(上海、江苏、山东、河南和安徽)的86株PEDV流行株的S1基因序列通过MEGA 7.0软件比较分析S1基因的遗传进化关系，采用CLC Sequence Viewer 8软件分析比对S1蛋白氨基酸序列的变异。PEDV S1基因遗传进化分析结果显示，97株PEDV中有92%的流行株属于G2型，与疫苗株CV777同源性较低(90.4%～96.1%)，山东地区2017年～2018年间的部分流行株与疫苗株CV777等属于G1型；G2型中，33%的流行株属于G2a型，67%的流行株属于G2b亚型，其中2019年～2021年的流行株有15%流行株属于G2a亚型，85%的流行株属于G2b亚型。S1蛋白关键表位的变异分析结果显示，与经典株CV777相比，中和表位COE (CO-26K equivalent epitope)发生8个氨基酸位点(A517S、S523G、V527I、T549S、G594S、A605E/D、L612F/Y、I635V)的突变，SS2区域无氨基酸变异，SS6发生1个氨基酸位点(Y766S)的突变，2018年后出现新的突变位点(T636I和S749G)。不同地区S1蛋白关键表位的变异分析结果显示，aa501变异在河南地区(L501P)和江苏地区(L501W)存在明显的差异；aa536突变(F536L)多集中于河南、山东地区的流行株，aa542突变(D542E)集中于江苏、上海地区。本研究首次系统分析了我国东部地区PEDV流行株S1基因及其氨基酸的遗传变异规律，为我国该地区PEDV变异株疫苗选择、生物安全防控方案制定提供了参考依据。

• 单位
  浙江农林大学; 金华职业技术学院; 动物科技学院