县域经济在我国经济发展中占据重要位置,在我国进入生态文明时代和经济新常态的背景下,产业的绿色转型成为县域经济发展的必然选择。省以下环保机构监测监察执法垂直管理的提出,为县域经济绿色发展中,树立县级环保部门执法权威,避免地方保护主义,推动县域企业绿色转型提供了制度保障.同时也对厘清权责、加快企业转型等提出了新的挑战。为应对垂直管理可能面对的挑战,应加强联动、为企业转型提供支持、提高公众参与质量。