系统性硬化症线粒体功能相关的差异表达基因的生物信息学分析

作者：巴燕娜; 苏丽萍; 刘曼玲; 袁晴; 吴振彪; 袁志栋^*

来源：细胞与分子免疫学杂志, 2019, 35(08): 707-713.

DOI：10.13423/j.cnki.cjcmi.008856

• 系统性硬化症(SSc)
• 线粒体
• 差异表达基因(DEG)

目的通过分析线粒体功能相关基因在系统性硬化症(SSc)患者皮肤活检组织中的表达情况来研究线粒体和SSc之间的关系。方法使用基因表达汇编(GEO)数据库中SSc皮肤活检组织基因芯片表达谱数据,采用t检验和倍数变化(FC)的差异基因分析方法筛选出线粒体功能相关的差异表达基因(DEG),并对其进行功能注释、功能富集和蛋白质相互作用网络分析。结果在SSc组织中共识别出422个显著差异的DEG,其中23个DEG是线粒体功能相关基因。对这23个基因进行功能注释和富集分析,发现异常表达的线粒体功能相关基因主要影响线粒体能量供应、细胞代谢等生物学过程。结论 SSc的发生发展伴随着线粒体功能相关基因的异常表达,提示线粒体功能异常与SSc发病相关。

• 单位
  中国人民解放军空军军医大学; 基础医学院; 西京医院