基于生物信息学方法分析外阴鳞癌的关键基因与信号通路

作者：滕飘飘; 倪观太; 丁锦^*

来源：齐齐哈尔医学院学报, 2022, 43(16): 1515-1518.

• 外阴鳞癌
• 基因表达谱
• 生物信息学分析
• 差异基因

目的 通过生物信息学方法，探索影响外阴鳞癌进展的关键基因与信号通路。方法 下载获取外阴鳞癌基因表达谱芯片GSE38228,利用公共数据库GEO分析外阴鳞癌与正常外阴组织间的差异表达基因，通过在线分析软件对差异基因进行功能富集、信号通路分析、蛋白质互作网络分析及核心基因的筛选。结果 以P<0.05和|log2FC(fold change)|≥2.0过滤后，外阴鳞癌与正常外阴组织共有294个差异表达基因，其中199个基因呈高表达，95个基因呈低表达。GO和KEGG分析发现，外阴癌高表达基因主要在氧化还原、外泌体、蛋白同源二聚体活性等功能上富集，低表达基因主要富集在上皮生长、细胞外基质等功能上。KEGG分析发现差异表达基因常与细胞外基质受体相互作用等有关。PPI网络分析发现角蛋白及细胞外基质蛋白基因可能在外阴鳞癌进展中起到关键作用。结论 通过芯片数据的生物信息学分析，角蛋白基因、细胞外基质相关基因在外阴鳞癌进展中可能发挥重要功能，期待进一步深入研究。

• 单位
  皖南医学院第一附属医院