胶质母细胞瘤相关基因的生物信息学分析

作者：刘洪超^*; 魏志豪; 张雨; 史康克

来源：西南军医, 2020, 22(03): 238-261.

• 胶质母细胞瘤
• 差异表达基因
• 信号通路
• 细胞粘附
• 生物信息学

目的筛选胶质母细胞瘤(GBM)相关的基因并进行生物信息学分析。方法从基因表达公共数据库中下载GSE65626表达谱数据集,运用BRB-Array Tools软件筛选差异表达基因(DEGs),然后对差异基因进行基因本体(GO)功能富集分析和Pathway富集分析,并建立与分析pathway互作网络。结果共筛选出572个DGEs,包括上调基因209个,下调基因363个。GO富集分析发现差异基因涉及细胞外基质聚合与分解、轴突引导、血管新生、细胞粘附与迁移等生物过程。Pathway富集分析结果表明ECM-受体互作、粘着斑、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、紧密连接等pathways显著富集。互作网络分析挖掘出的核心pathways包括细胞骨架调节、黏着连接、粘着斑和MAPK信号通路。结论 GBM组织和正常脑组织之间的基因表达谱不同,为进一步探索GBM病理发生的分子机制提供了潜在的基因靶标。