基于文本挖掘与分子对接技术的辣木叶功能定位研究

作者:沙子珺; 唐仕欢; 李志勇*; 杨滨*; 杨洪军
来源:中国中药杂志, 2020, 45(02): 331-340.
DOI:10.19540/j.cnki.cjcmm.20191104.108

摘要

该文以辣木叶为研究对象,探索基于文本挖掘与分子对接技术的外来药用资源研究新方法。通过PubMedplus分面检索与聚类分析系统,对辣木叶相关文献进行数据分析,总结研究热点、研究特征以及发展趋势,并筛选其适应症;利用Arrowsmith进行非相关文献挖掘,获得辣木叶与筛选所得疾病的交集靶点;通过查阅相关文献,收集辣木叶化学成分,经SwissADME过滤,获得辣木叶候选活性成分。采用systemsDock将辣木叶候选活性成分与上述靶点进行分子对接,预测辣木叶治疗疾病的潜在物质基础及潜在作用靶点,并利用DAVID数据库平台对潜在靶点进行GO注释分析。筛选所得辣木叶相关疾病为肿瘤,糖尿病及消化系统疾病,分子对接结果表明12个潜在作用靶点及25个活性成分可能与辣木叶治疗上述3种疾病有关,GO注释分析结果提示其作用机制可能与G蛋白偶联受体、炎症反应等有关。该文探索并实践了由文本挖掘方法与分子对接相结合的外来药用资源功能定位研究的思路与方法,从适应症,化学成分和作用机制等方面对辣木叶的药效物质基础与作用特点进行初步研究,为其他外来药用资源引入提供有益借鉴和参考。

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