绵羊KCNH1基因的生物信息学分析

作者:张小雪; 赵利明; 刘佳; 杨晓斌; 李冲
来源:甘肃农业科技, 2022, 53(03): 39-45.
DOI:10.3969/j.issn.1001-1463.2022.03.009

摘要

以绵羊钾电压门控通道H亚家族成员1(potassium voltage-gated channel subfamily H member 1,KCNH1)基因为研究对象,利用生物信息学数据库及其相关软件,对其进行生物信息学分析,以初步了解其结构和生物学功能。结果表明,绵羊KCNH1基因所含最大长度序列为2 961 bp,且编码986个氨基酸残基。KCNH1基因编码的蛋白质分子式为C4972H7816N1342O1447S40,其蛋白分子质量为110 827.28 KDa,理论等电点(pI)为7.52。亚细胞定位结果表明其编码产物主要可能定位于质膜(43.5%),其次为内质网(34.8%),属于非分泌蛋白。KCNH1蛋白质中不存在信号肽序列,但存在5段跨膜结构区域,该蛋白的二级结构以α螺旋为主,三级结构主要由α螺旋盘曲缠绕的方式形成。

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