基于16S rRNA基因测序的慢性自发性荨麻疹患者肠道菌群差异研究

作者：闫慧敏; 杜笑; 孟令贺; 翁立硕; 曾三武^*

来源：中华皮肤科杂志, 2021, 54(12).

• 荨麻疹
• 微生物群落
• 胃肠道
• RNA, 核糖体, 16S
• 计算生物学
• 慢性自发性荨麻疹

目的研究慢性自发性荨麻疹(CSU)患者和健康人的肠道菌群差异。方法收集2019年1-12月在天津市第一中心医院皮肤科就诊的18例CSU患者(CSU组)及年龄、性别相匹配的18例健康对照(HC组)的粪便标本, 提取总DNA, 利用16S rRNA测序技术鉴定微生物种类, 用生物信息学方法分析菌群差异。采用SPSS 23.0软件对试验数据进行统计学分析。结果在α多样性方面, CSU组Observed OTU指数161.28 ± 35.47, Chao1指数161.31 ± 35.51, Shannon指数5.15 ± 0.47, Simpson指数0.94 ± 0.03, HC组分别为154.89 ± 54.46、154.92 ± 54.43、4.92 ± 0.88、0.91 ± 0.08, 两组差异均无统计学意义(t = 0.417、0.417、0.952、1.116, 均P > 0.05)。在β多样性方面, 主成分分析显示, 两组的第一主成分解释度为6.66%, 第二主成分解释度为4.93%, 两组菌群结构差异无统计学意义(P = 0.672)。CSU组、HC组肠道菌群Holdemania菌属相对丰度分别为0.04%、0.01%, 两组间差异有统计学意义(P = 0.025)。结论 CSU患者与健康人肠道菌群存在一定差异。

• 单位
  天津中医药大学; 天津市第一中心医院; 南开大学