应用Logistic回归与多因子降维法分析胃癌易感基因多态性

作者：张文涛; 梁平; 代鹏; 王伟华; 汪钦; 孙建斌; 王伟; 颜真

来源：中国生物制品学杂志, 2014, 27(05): 679-683.

DOI：10.13200/j.cnki.cjb.000293

• 胃癌
• 单核苷酸多态性
• Logistic回归
• 多因子降维法

目的应用Logistic回归与多因子降维法(multifactor dimensionality reduction,MDR)分析胃癌易感基因多态性,为胃癌的早期诊断和预警奠定基础。方法采用病例-对照研究,以中国西北476例汉族胃癌患者为病例组,361名非肿瘤、非消化系统疾病个体为对照组;通过候选基因策略,应用MassARRAY质谱平台分析与代谢、炎症相关的18个基因的37个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点;利用Logistic回归与MDR对基因分型结果进行分析。结果 Logistic回归分析显示,磷脂酶Cε1(phospholipase C epsilon 1,PLCE1)rs3765524[OR=1.341,95%CI(1.003,1.792)]、还原型辅酶Ⅰ/Ⅱ醌氧化还原酶1[NAD(P)H:quinone oxidoreductase 1,NQO1]rs1800566[OR=0.615,95%CI(0.418,0.903)]、X线修复交叉互补基因1(X ray repair cross complementing gene 1,XRCC1)rs25487[OR=0.688,95%CI(0.490,0.967)]3个SNP位点的基因型分布与胃癌易感性显著相关(P<0.05);MDR分析显示,PSCArs10216533-XRCC1rs25487[模型Ⅰ:OR=3.566,95%CI(2.614,4.863)]、MTHFRrs1801131-PSCArs2976392-CYP17A1rs6163-CYP19A1rs4646-CYP19A1rs1902586-MMP2rs243865[模型Ⅱ:OR=7.257,95%CI(5.337,9.870)]、IL1Brs16944-PSCArs10216533-CYP17A1rs6163-NQO1rs1800566-ENOSF1rs2298581-XRCC1rs25487[模型Ⅲ:OR=15.837,95%CI(11.252,22.289)]3个模型内部各位点之间具有显著交互作用(P<0.000 1)。结论 PLCE1、NQO1、XRCC1、PSCA、MTHFR、CYP17A1、CYP19A1、MMP2、IL1B、ENOSF1等基因多态性与我国西北地区汉族人群胃癌发病风险相关;在胃癌的早期诊断与预警中应联合Logistic回归和MDR等方法,兼顾单因素与多因素交互的影响进行综合分析。

• 单位
  第四军医大学; 肿瘤生物学国家重点实验室