赖氨酸去甲基化酶5C对肾癌转移的作用研究

作者：陈宁黛; 周冰倩; 陈哲逸; 陈诗宇; 郑英霞^*

来源：上海交通大学学报 (医学版), 2023, 43(05): 571-579.

• 赖氨酸去甲基化酶5C
• 肾透明细胞癌
• 迁移
• 上皮-间充质转化

目的·研究失活的蛋白赖氨酸去甲基化酶5C(lysine demethylase 5C,KDM5C）对肾透明细胞癌迁移、侵袭的作用，分析它调控的基因，探索其失活后促癌的机制。方法·使用慢病毒构建KDM5C稳定敲除的人肾透明细胞癌786-O、Caki-1细胞株，通过Transwell小室观察肾癌细胞KDM5C敲除后迁移、侵袭的变化，蛋白质印迹法检测上皮-间充质转化（epithelial-mesenchymal transition,EMT）相关蛋白表达的变化；用786-O Control-sg、KDM5C-sg 2组细胞RNA测序数据和癌症基因组图谱（The Cancer Genome Atlas,TCGA）公共数据库做差异基因分析、功能通路富集分析，进一步探索KDM5C缺失后的促癌机制。根据EMT基因集筛选出测序数据中上调的EMT相关基因，并通过生存分析、单因素COX分析对基因进行初步筛选，最后通过LASSO回归分析、风险森林模型进一步筛选与KDM5C敲除后表型高度相关的基因。结果·KDM5C敲除后786-O和Caki-1细胞较对照组细胞表现出较为明显的迁移和侵袭表型（P=0.000）。TCGA数据库分析表明肾癌患者KDM5C突变会导致患者的预后情况变差（P=0.042）。RNA测序分析表明KDM5C敲除后可能通过影响黏附相关分子、上调上皮-间充质转化相关基因。通过蛋白质印迹法检测到2组细胞在敲除KDM5C后β-catenin、Vimentin、Snail蛋白表达水平均发生上调。最后将生存分析、单因素COX分析中得到的10个上调EMT基因进行LASSO回归分析、风险森林模型预测，结果表明KDM5C可能对PLAUR基因具有调控作用。结论·KDM5C在肾癌中突变可通过增强肿瘤迁移和侵袭促进肾癌的发生发展。

• 单位
  上海交通大学医学院附属新华医院