茶树CsCCT基因家族的鉴定和表达模式分析

作者：姚新转; 张宝会; 赵德刚; 吕立堂^*

来源：分子植物育种, 2022, 20(14): 4611-4623.

DOI：10.13271/j.mpb.020.004611

• 茶树
• CCT基因家族
• 基因组鉴定
• 基因表达分析
• RT-PCR分析

CCT (CO, COL和TOC1)家族基因，在植物生长发育和适应环境变化的过程中具有重要的调节作用。本研究利用生物信息学方法，对茶树基因组中鉴定到的44个CCT基因进行了基础生物信息分析，同时分析了它们在PEG诱导的干旱胁迫、盐胁迫、茉莉酸甲酯胁迫和冷处理中的转录组数据。结果表明，44个茶树CsCCT基因在茶树染色体上分布不均；根据进化关系将茶树CCT基因分为COL (Constant-like)、PRR(Pseudo-response regulator)和CMF (CCT motif family)；通过基因结构与保守基序分析发现，相同亚家族的基因结构和保守结构域基本一致；顺式作用元件分析发现，激素、植物发育和胁迫响应都与顺式作用元件相关；基因表达分析显示，CsCCT基因在花和果实组织中具有较高的表达水平，且部分基因随着叶片成熟度的增加，表达水平升高；不同的CsCCT基因在PEG诱导的干旱胁迫、盐胁迫、茉莉酸甲酯胁迫和冷处理下存在差异表达，经RT-PCR分析CCT不同基因在茶树各组织表达有一定的差异和转录数据表达趋势基本一致。本研究为进一步揭示CsCCT在茶树生长发育以及抗逆响应中提供参考依据。

• 单位
  生命科学学院; 贵州大学; 贵州省农业科学院