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摘要
在分析比较多种植物异胡豆苷合成酶(STR)氨基酸序列特征的基础上，确定马蓝STR蛋白的生物信息学特征，为该蛋白的后续研究提供参考。利用生物信息学方法对马蓝及其他76种植物共101条STR氨基酸序列在序列组成、生化特性、信号肽、导肽、跨膜结构、卷曲螺旋结构、蛋白质二级、三级结构及其功能结构域等方面进行预测分析，并进行了植物的同源比对及蛋白系统进化树的构建。蛋白同源性比对结果显示，马蓝STR与胡麻科植物芝麻的同源性最高；所有STR蛋白氨基酸残基数集中在391 aa以上，相对分子质量43.932 kD，理论等电点约5.88，提示STR为酸性蛋白；序列结构预测结果显示，STR蛋白亲水区域多于疏水区域，多数存在信号肽和分泌途径导肽，少数具有跨膜结构域；蛋白质二级结构中最主要的结构元件是β-转角和无规则卷曲，含有STR活性结构域。通过分析所得的马蓝等植物STR蛋白的生物信息学特征可为今后进行该酶基因的克隆与功能研究，以及后续的蛋白代谢途径与药效物质生物合成调控网络等方面的研究提供基础。
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单位泉州医学高等专科学校; 长征医院; 华侨大学; 中国人民解放军第二军医大学
