GⅡ.4型诺如病毒VP2蛋白生物信息学分析

作者：林鹏; 黄玉雯; 李学鹏; 励建荣^*

来源：现代食品科技, 2023, 39(09): 42-51.

DOI：10.13982/j.mfst.1673-9078.2023.9.1140

• 诺如病毒
• VP2蛋白
• 生物信息学

为了解诺如病毒VP2蛋白的生物学特征，该研究以当前诺如病毒GII.4型流行毒株VP2蛋白为研究对象，应用生物信息学软件对VP2蛋白的理化性质、磷酸化位点、糖基化位点、跨膜区、信号肽、二级结构、三级结构、抗原决定簇和B细胞抗原表位进行预测分析。结果表明，诺如病毒流行毒株VP2蛋白为稳定的亲水性蛋白，平均等电点为10.47、吸水系数为-0.47、不稳定系数为47.91，碱性氨基酸约占含量的11.60%；该蛋白含有约43个潜在的磷酸化修饰位点和2个潜在的糖基化修饰位点；大多数毒株不存在跨膜区和信号肽，然而GI.3型诺如病毒VP2蛋白存在跨膜区和信号肽；诺如病毒VP2蛋白二级结构中α-螺旋平均占比38.17%、延伸链平均占比7.45%、β-折叠平均占比6.25%、无规则卷曲平均占比48.13%；三级结构预测模型的蛋白覆盖率为56.70%；平均存在8个潜在的蛋白质抗原决定簇和25个B细胞抗原表位。该研究运用生物信息学分析方法预测当前GII.4型诺如病毒流行毒株VP2蛋白的理化性质和结构等方面，为进一步深入研究诺如病毒VP2蛋白功能奠定了理论基础。

• 单位
  渤海大学