厦门市临床分离的466株结核分枝杆菌基因分型研究

作者：张建梅; 郑蓉蓉; 曾小红; 翁琴云; 黄建炜; 牛建军

来源：现代预防医学, 2016, 43(22): 4159-4187.

• 实时荧光PCR
• 结核分枝杆菌
• 北京家族
• 基因分型
• 间隔区寡核苷酸分型

目的了解厦门市结核分枝杆菌基因类型分布及主要流行基因群情况,并建立分型数据库。方法采用实时荧光PCR法对厦门市2013-2015年分离到的466株结核分枝杆菌临床分离株进行菌株确认,然后采用间隔区寡核苷酸分型方法(spoligotyping)对其进行基因分型。分型结果与Spol DB4数据库进行比对,并使用Bionumeric6.6.4软件进行基因聚类分析。结果 466株菌均为结核分枝杆菌,基因分型分成96种基因型别,62种数据库中有相应的SIT编号,34种为新的型别。97.64%(455/466)的菌构成了15个基因簇。466株菌属于7个基因家族及未定义家族,排在前三的分别为:Beijing(北京)家族60.09%(280/466)、T家族21.03%(98/466)、H家族5.58%(26/466)。结论厦门市结核分枝杆菌基因型别呈现多样性,北京家族为主要的流行基因群。

• 单位
  厦门大学; 厦门大学附属中山医院; 厦门市疾病预防控制中心; 生命科学学院