荣昌猪肝组织全长cDNA文库的构建和EST测序及分析

作者：甘玲; 黄庆洲; 梅宏远; 杨滨宇

来源：云南大学学报(自然科学版), 2016, (03): 487-493.

• 荣昌猪
• 肝脏
• 全长cDNA文库
• LD PCR
• SMART技术 Rongchang Pigs
• liver
• full-length cDNA library
• LD-PCR
• SMART technology

研究旨在为荣昌猪种质资源的保存、开发和挖掘提供重要的分子信息,同时也为荣昌猪作为生物医学模型,代谢疾病的研究提供基础数据.运用SMART法构建了荣昌猪肝组织的c DNA文库,并从文库中随机挑取部分克隆进行EST测序和功能注释.经检测,构建的原始文库滴度为4.19×106pfu/m L,重组率为96.31%,平均插入片段长度主要在400~2 000 bp之间.总共获得了226条有效EST序列,共计161个unigenes,包括19个重叠群(contigs)和142条单一序列(singlets).101(62.73%)条为已知功能基因序列,60(37.27%)条为未知功能序列,其中40条为新基因序...

• 单位
  西南大学荣昌校区