炭样小单孢菌JXNU-1双组分信号转导系统的生物信息学分析

作者：胡桂花; 陈彪; 黄运红; 龙中儿^*

来源：基因组学与应用生物学, 2020, 39(11): 5106-5114.

DOI：10.13417/j.gab.039.005106

• 炭样小单孢菌JXNU-1
• 双组分信号转导系统(TCS)
• 组氨酸激酶(HK)
• 应答调控蛋白(RR)
• 生物信息学分析

基于一株具有生产广谱抗菌活性产物,且已完成全基因组测序的炭样小单孢菌JXNU-1 (Micromonospora carbonacea JXNU-1),本研究采用生物信息学方法系统分析了该菌株的双组分信号转导系统(two-component system, TCS)的分布、结构及功能。结果显示,炭样小单孢菌JXNU-1中共有38个HKs,46个RRs,以及3个杂合TCS蛋白。这些功能蛋白一共配对形成了17个TCS,其中调控炭样小单孢菌JXNU-1的金属离子吸收、盐分代谢的相关的TCS数量最多(6个)、与菌体生长、胁迫感应相关的TCS有5个,参与细菌毒力调节的TCS有3个。此外,有的TCS具有多重生物学功能。这些TCS共同调控菌体以更好地适应环境。

• 单位
  生命科学学院; 江西师范大学