桉树焦枯病菌MDR基因生物信息学分析及功能解析

作者:张清华; 陆芝; 张晓阳; 刘宏毅; 丁奕; 叶小真; 冯丽贞*
来源:福建农林大学学报(自然科学版), 2019, 48(01): 88-96.
DOI:10.13323/j.cnki.j.fafu(nat.sci.).2019.01.015

摘要

通过生物信息软件及qPCR对桉树焦枯病菌MDR蛋白的序列特征、蛋白结构、理化性质及MDR基因在不同条件下的表达情况进行分析.结果表明,MDR转运蛋白均由α-折叠、无规则卷曲、β-转角,所占百分比α-折叠>β-转角>无规则卷曲.三级与二级结构预测均显示桉树焦枯病菌MDR具有典型的MDR蛋白结构,说明该蛋白家族的进化比较保守;CpABCB10基因参与调控分生孢子稳定性和萌发,CpABCB4和CpABCB9基因参与调控金属离子的转运,CpABCB7和CpABCB8基因参与调控桉树焦枯病菌的抗药机制.此外,CpABCB7基因还能参与调控桉树焦枯病菌的整个致病过程.

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