浙江省麻疹病毒的基因特征分析

作者：孙海燕; 崔大伟; 童海江

来源：中国微生态学杂志, 2017, 29(01): 30-36.

DOI：10.13381/j.cnki.cjm.201701008

• 麻疹病毒
• 基因特征
• 进化树
• 变异

目的分析浙江省流行的麻疹病毒(MV)的基因特征,为更好地防控麻疹提供科学参考。方法从GenBank检索并下载浙江省所有麻疹病毒株、中国麻疹疫苗株和WHO推荐参考株的血凝素蛋白(H)和核蛋白(N)的基因组序列,利用MEGA 6.0软件进行比对分析,构建种系进化树,确定浙江省麻疹病毒流行的基因型别,并进行同源性和基因变异分析。结果浙江省麻疹病毒以H1基因型为主(27株),其他基因型为辅(2株B3型)。H1a亚型(21/27)占绝对优势,其次为H1b亚型(6/27)。浙江省所有毒株间H蛋白的氨基酸同源性为96.9%100.0%,与疫苗株Shanghai-191和Changchun-47的同源性均为95.0%96.0%。浙江省所有毒株间N蛋白羧基末端的氨基酸同源性为82.7%100.0%,与疫苗株Shanghai-191的同源性为85.8%89.5%,与疫苗株Changchun-47的同源性为87.3%91.0%。结论麻疹病毒H1基因型为浙江省麻疹流行的优势株,与现行参考疫苗株(A基因型)差异较大,因此针对麻疹病毒H1基因型疫苗的研制是今后浙江省麻疹病毒防控的关键。

• 单位
  绍兴第二医院; 浙江大学医学院附属第一医院